Назад

Аденовирус F40/F41, ДНК, ПЦР в режиме реального времени (кал)

Код:6015

Синонимы
Аденовирус, серотипы F40/F41 [полимеразная цепная реакция в режиме реального времени].AdVAdenovirus F40/F41 DNA, real-time PCRAdenovirus serotypes F40/F41Enteric adenovirusGroup F adenovirusHAdV

Детали анализа

Метод исследования

  • Полимеразная цепная реакция в реальном времени (RT-PCR)

Ожидаемое время выполнения

1 день

Особые указания

  • No specific patient preparation is required.

Как использовать

Тест «Аденовирус F40/F41, ДНК, ПЦР в режиме реального времени (кал)» обнаруживает человеческий аденовирус (HAdV) группы F серотипов 40/41 в кале для помощи в диагностике аденовирусного гастроэнтерита. Этот молекулярный анализ нацелен на ДНК энтерических аденовирусов и применяется в сочетании с клинической оценкой и другими лабораторными исследованиями; он не предназначен для мониторинга ответа на терапию или элиминации.

Ограничения

Человеческие аденовирусы — безоболочечные ДНК-содержащие вирусы семейства Adenoviridae. Более 68 серотипов объединены в семь видов (A–G) и ассоциированы с различными синдромами, включая острое респираторное заболевание, конъюнктивит, геморрагический цистит и гастроэнтерит. Аденовирус обусловливает приблизительно 4%–12% случаев вирусного гастроэнтерита и занимает второе место после ротавируса. Заболевание чаще всего возникает у детей младше двух лет, хотя подростки и взрослые также могут болеть; тяжелые проявления могут развиваться у иммунокомпрометированных лиц (например, после трансплантации стволовых клеток или при СПИДе). Клиническая картина коррелирует с серотипом. Энтерические типы F40 и F41 ассоциированы с гастроэнтеритом, тогда как другие серотипы, такие как C1 и B7, типично связаны с респираторной патологией. Диагностические подходы включают электронную микроскопию (широкий спектр обнаружения, но ограниченная чувствительность), вирусологическое культивирование (медленно и особенно затруднительно для F40/F41), выявление антигена с помощью иммуноанализа или латекс-агглютинации (быстро и специфично, но менее чувствительно), а также методы на основе нуклеиновых кислот. ПЦР в режиме реального времени, выполненная на кале, обеспечивает высокую аналитическую чувствительность и специфичность для ДНК аденовируса при использовании праймеров, нацеленных на серотипы F40/F41. Количественные форматы позволяют оценивать вирусную нагрузку для эпидемиологических задач. Ограничения включают сохранение детектируемой нуклеиновой кислоты после эффективной терапии, что делает тест непригодным для мониторинга лечения. Чувствительность максимальна при отборе образцов до начала противовирусной терапии. Результаты требуют интерпретации в контексте клинических данных и дополнительных лабораторных исследований.

Референсный интервал
ПоказанияAcute gastroenteritis characterized by vomiting, diarrhea, abdominal cramping, and fever, Evaluation of suspected enteric adenovirus infection in infants and toddlers younger than 2 years

Возможные причины отклонений

Пониженный уровень

  • cidofovir
  • ribavirin

Требования к образцу

ОбразецКал
КонтейнерСтерильный контейнер для кала

Ссылки

Logan C, O'Leary JJ, O'Sullivan N. Real-time reverse transcription-PCR for detection of rotavirus and adenovirus as causative agents of acute viral gastroenteritis in children. J Clin Microbiol. 2006 Sep;44(9):3189-95.

Jothikumar N, Cromeans TL, Hill VR, Lu X, Sobsey MD, Erdman DD. Quantitative real-time PCR assays for detection of human adenoviruses and identification of serotypes 40 and 41. Appl Environ Microbiol. 2005 Jun;71(6):3131–6.

Sriwanna P, Chieochansin T, Vuthitanachot C, Vuthitanachot V, Theamboonlers A, Poovorawan Y. Molecular characterization of human adenovirus infection in Thailand, 2009-2012. Virol J. 2013 Jun 13;10:193. doi: 10.1186/1743-422X-10-193.

Ebner K, Rauch M, Preuner S, Lion T. Typing of human adenoviruses in specimens from immunosuppressed patients by PCR-fragment length analysis and real-time quantitative PCR. J Clin Microbiol. 2006 Aug;44(8):2808-15.